Yu ☆ Gi ☆ Oh! Arc-V centrā ir Yuuya Sakaki, noslēpumains izklaides duelis, pazīstams kā “The Phantom”, kā arī viņa trīs citas personības: Yuuto, Yuugo un Yuuri. Leo Corporation viņu vajāja par uzlaušanu viņu Solid Vision ar masu sistēmu un izmantoja to saviem mērķiem.
Brauciena laikā viņš satiekas ar Juzu Hiiragi, Syu Zo Duel skolas direktora meitu, kura bija uz bankrota robežas un izlēma Yuuya noslēgt līgumu kļūt par skolotāju savā skolā. Tomēr, pirms Yuuya varēja mācīt skolā, viņam vispirms jāatrod karte ar nosaukumu Genesis Omega Dragon, kas teica, ka tas noteiks pasaules likteni, kas arī saistīta ar viņa izkaisītajām atmiņām.
Stāsts ir izveidots Maiami pilsētas alternatīvajā versijā, kur Leo Corporation, kuru vada tās prezidents Reidži Akaba, dominē lielākajā daļā Solid Vision sistēmas visā pilsētā. Uzņēmuma Solid Vision izplatīšanās ar masu ne tikai dzemdēja “Rīcības divcīņas”, bet arī palīdz uzlabot pilsētu, glābjot dzīvības un novēršot postījumus katastrofu gadījumā, kļūstot par būtisku
