Pēdējais pasūtījums sākas, kad Desty Nova nanotehnoloģija atdzīvina Alitu peldošajā Tiphares pilsētā. Pilsētas melnie noslēpumi tiek ļaunprātīgi atklāti, taču šķiet, ka tā ir maza daļa no sarežģītās pasaules. Dodoties kosmosā kopā ar veciem un jauniem uzņēmumiem, lai uzzinātu vairāk par viņas aizmirsto pagātni un vienlīdzīgi, lai meklētu savu pazudušo palu Lou Kolinsu, Alita ir nokļuvusi starpplanētu cīņā starp kolonizētās Saules sistēmas galvenajiem spēkiem. Pa ceļam viņa izveido aliansi ar trim Alita Replicām, kas tagad sākušas ticēt par sevi, par negaršīgu superhackeri, un ar pašu Novu, kad viņa iekļūst lietas Zenith Tournament (ZOTT) cīņas konkursā, kas tiek rīkots ik pēc 10 gadiem. Ieskaitot veidu, kādā Zeme parādījās no kataklizmātiskas trieciena ziemas, kas visā stāstījuma garumā iznīcināja lielāko sabiedrības daļu, ir parādīta vairāk vēstures par kaujas eņģeļa Alita iestatījumu, kas nebija atklāts iepriekšējā virknē.
